El Lago Titicaca recibe siete descargas directas de la red de desagües de Puno y varias de la actividad agrícola, además desembocan en él varios ríos que acumulan desechos en sus recorridos.
Se ha formado una alfombra gruesa de algas que impiden el paso de la luz y perjudican la oxigenación del lago, es decir, afectan severamente el desarrollo ecológico del ecosistema
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